醫院院徽以銀杏葉為主畫面，葉中鏤空一個“十”字，鏤空的“十”字內懸掛一蛇杖，曲彎在蛇杖上的蛇形組成一個阿拉伯數“3”字，整個圖形簡潔明快、意境深遠。

銀杏葉、果本是良藥，杏林又是傳統醫療行業的美稱，杏樹兼有活化石之美譽，我們醫院又獨一無二存有一顆百年銀杏樹，寓情于樹，寓葉予情，銀杏葉當之無愧成了院徽的主要元素。

葉中鏤空的白“十”字是我國衛生行業“四紅心白十字”徽的核心部分，也是婦孺皆知的衛生行業徽。

蛇杖是古希臘醫神埃斯克萊庇厄斯的手中驅邪祛病的器物，后人將其定為現代醫學的標徽并在世界各國得到了認可。靈蛇如同阿拉伯數“3”字的點化，畫龍點睛地將醫院序數巧奪天工表現了出來，整個銀杏葉的葉面朝下如同豐羽的雁、亮翅的鵬和開屏的孔雀，纖細的銀杏葉梗挺起如同昂揚的鷹頭將整個銀杏葉虛幻為一只騰飛的鷹，整個醫院標徽的寓意就是三醫院將秉承傳統醫學的衣缽，發揚現代醫學精神而展翅騰飛。

今天的三醫院人在杏樹里摘取一片杏葉作為醫院文化的載體來傳承古今，再將古希臘醫神埃斯克萊庇厄斯的蛇杖杵起來貫穿中外，一個傳統醫學的元素，一個現代醫學的符號，用神來之筆點睛在醫院的文化里，添彩在醫院的歷史中，三醫院人將秉承懸壺濟世的醫德，恪守希波克拉底的誓言，將傳統醫學和現代醫學發揚光大，博醫精誠我們不辱杏林傳人的使命，德技雙馨我們不負日內瓦醫生宣言。